三、基因測序公司（NGS）的發(fā)展方向：測序是起點(diǎn)而不是終點(diǎn)
如果是基因測序產(chǎn)業(yè)上游的公司，產(chǎn)品銷售的目標(biāo)客戶廣泛，橫跨科研、醫(yī)療、商檢領(lǐng)域，產(chǎn)品包括測序儀、DNA提取試劑盒、捕獲試劑盒/多重子擴(kuò)增試劑盒、建庫試劑盒、上機(jī)測序試劑盒，其中測序儀、上機(jī)測序試劑盒兩者是綁定的，DNA提取試劑盒、捕獲試劑盒/多重子擴(kuò)增試劑盒、建庫試劑盒是可以用第三方的產(chǎn)品，國內(nèi)企業(yè)可以從這三個方向切入，但是試劑盒中的最關(guān)鍵的工具酶以及分離材料等都還是以進(jìn)口產(chǎn)品為主，壁壘較高，如果能實現(xiàn)這兩個產(chǎn)品的進(jìn)口替代，說明企業(yè)具有較強(qiáng)的技術(shù)實力。
在科研和商檢領(lǐng)域，試劑盒的審批門檻較低，但是需要提供定制化服務(wù)；在醫(yī)療診斷領(lǐng)域，多基因的捕獲試劑盒/多重子擴(kuò)增試劑盒不大可能通過CFDA審批（前面已經(jīng)說明原因），只有通過認(rèn)證的臨檢實驗室才能夠以自制試劑使用，因此這部分企業(yè)（思路迪、世和基因、燃石生物等）需要做兩手準(zhǔn)備，籌備建設(shè)臨檢中心，向服務(wù)端布局。
測序是起點(diǎn)而不是終點(diǎn)，做中游測序服務(wù)的機(jī)構(gòu)，最大的市場還是在醫(yī)療診斷領(lǐng)域，除了通過提供服務(wù)獲得收益外，測序機(jī)構(gòu)最大的潛在優(yōu)勢是能夠獲得特殊患者的組織樣本，并且獲得基因數(shù)據(jù)的積累，這對于藥物開發(fā)是十分便利的條件。
比如說，腫瘤患者在使用某靶向藥物后出現(xiàn)耐藥性，測序機(jī)構(gòu)通過基因測序發(fā)現(xiàn)了新的耐藥位點(diǎn)（這是PCR、基因芯片這種檢測已知突變位點(diǎn)的技術(shù)所不具備的優(yōu)勢），那么這個位點(diǎn)就是下一款靶向藥物的開發(fā)方向，并且測序機(jī)構(gòu)還可以獲得患者的腫瘤組織，以此培養(yǎng)原代細(xì)胞株，作為藥物開發(fā)的細(xì)胞模型，這就比其他的藥物研發(fā)機(jī)構(gòu)擁有更多的先發(fā)優(yōu)勢。
我個人看好思路迪的發(fā)展模式，以自己的測序服務(wù)為橋梁，打通患者、醫(yī)院、CRO企業(yè)，測序結(jié)果提供用藥指導(dǎo)，同時反過來鏈接下游藥物開發(fā)和臨床試驗，形成良好的反饋機(jī)制。
案例（美國腫瘤測序公司Foundation Medicine）：
Foundation Medicine是一家專注于腫瘤高通量測序的商業(yè)公司，該公司專有的平臺可產(chǎn)生對病人的個體癌癥可操作的基因組信息，使醫(yī)生能夠在臨床實踐中優(yōu)化治療，使生物制藥公司制定有針對性的癌癥療法更加有效。
該公司以二代基因測序技術(shù)為基礎(chǔ)，根據(jù)癌癥基因測序結(jié)果給腫瘤患者提供精準(zhǔn)的用藥指南。該公司的基因測序技術(shù)能夠發(fā)現(xiàn)導(dǎo)至患者罹患癌癥的基因突變，讓“個體化用藥”走進(jìn)了新領(lǐng)域，讓醫(yī)生能夠根據(jù)患者的遺傳信息進(jìn)行有針對性的癌癥治療。
Foundation Medicine的服務(wù)需要醫(yī)生訂購，患者只需提供10余個病例組織切片或者一管幾毫升的血液。從提取腫瘤細(xì)胞的DNA到最終的報告，持續(xù)時間14-21天，其中包含了檢測出來的癌癥基因突變情況，以及針對每一種突變基因給出的用藥指導(dǎo)建議。
Foundation Medicine提供兩種產(chǎn)品，F(xiàn)oundationOne和FoundationOne Heme。兩種產(chǎn)品均是以二代基因測序為基礎(chǔ)，使用的測序儀包括Illumina HiSeq 2000 system和 Life Technologies' Ion Torrent。FoundationOne檢測適用于所有實體瘤，檢測315個癌癥相關(guān)基因的編碼區(qū)域以及28個基因的內(nèi)含子重排，費(fèi)用為$5800。FoundationOne Heme檢測針對血液惡性疾病、淋巴瘤、白血病等，檢測405個基因的編碼區(qū)序列和31個基因的內(nèi)含子重排，以及265個基因的RNA序列來檢測基因融合，費(fèi)用為$7200。FoundationOne檢測的方法在2013年10月時發(fā)表在了Nature Biotechnology上。
進(jìn)行癌癥基因測序檢測需要癌癥基因的數(shù)據(jù)庫，公司因而建立了數(shù)據(jù)庫FoundationCORE。公司在2014年12月推出了瀏覽器ICE 2，該瀏覽器的一大特點(diǎn)是“患者匹配”功能。臨床醫(yī)生可以通過它在已有的知識庫FoundationCORE中搜索，尋找與患者腫瘤基因組類似的其他患者的信息。ICE 2的一個新的組成部分是PatientMatch，是一種利用FoundationCORE來增加FoundationOne和 FoundationOne Heme使用率的技術(shù)工具。通過PatientMatch，使用ICE 2網(wǎng)絡(luò)的醫(yī)生可以與在治療具有類似基因資料病人的醫(yī)生相聯(lián)系，和他們分享診斷結(jié)果合治療方案。根據(jù)公司2015年第三季度的報告，F(xiàn)oundationCORE已包含6萬個臨床病例信息。
Foundation Medicine一直在努力的一個領(lǐng)域是醫(yī)保問題。2014年，密歇根州的大溪城重點(diǎn)衛(wèi)生部門宣布把Foundation Medicine的癌癥基因組分析服務(wù)納入醫(yī)保范圍；Google表示谷歌公司將該公司的癌癥基因的DNA檢測服務(wù)，作為其員工福利計劃的一部分。Foundation Medicine還通過了McKesson診斷交易所和美國國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)的認(rèn)可，能夠?qū)Ψ切〖?xì)胞肺癌進(jìn)行全基因組檢測，并且收到了獨(dú)特的Z-code標(biāo)識符。此外，F(xiàn)oundation Medicine首席財務(wù)官Jason Ryan表示，醫(yī)保范圍不僅在肺癌中逐步擴(kuò)大，還將會逐步涉及到其他疾病服務(wù)。
Foundation Medicine的營業(yè)收入主要來自兩個方面，一個是來自生物制藥公司，另一個是來自臨床診斷。2015年第三季度，來自生物制藥公司的收入為1170萬美元，與去年同期相比增長75%；來自臨床診斷的收入為1370萬美元，與去年同期相比增長40%，營收增長非常明顯。
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